新疆大学党委办公室、大学办公室是学校党委的重要办事机构和综合职能部门，下设秘书科、信息科、机要保密科、督查室、法务科、行政科、国内合作与交流科7个科室。

办公室的主要职能：围绕学校中心工作，积极发挥学校领导的参谋助手、学校的信息枢纽、校内的上传下达、决策的督促检查、国内合作的对接联动、对口支援的综合协调、校友的组织联络，服务领导、服务基层、服务师生，承上启下、联系左右、沟通内外，做好管理和服务等相关工作。